Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl27P61358 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms