Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf13P61216 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf13P61216 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf13P61216 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf13P61216 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf13P61216 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms