Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chp1P61022 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chp1P61022 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chp1P61022 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chp1P61022 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chp1P61022 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chp1P61022 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chp1P61022 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chp1P61022 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chp1P61022 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chp1P61022 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms