Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2iP60898 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms