Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rims4P60191 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rims4P60191 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rims4P60191 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rims4P60191 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rims4P60191 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rims4P60191 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rims4P60191 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rims4P60191 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rims4P60191 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rims4P60191 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rims4P60191 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rims4P60191 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rims4P60191 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rims4P60191 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rims4P60191 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rims4P60191 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rims4P60191 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rims4P60191 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rims4P60191 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims4P60191 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rims4P60191 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims4P60191 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims4P60191 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rims4P60191 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rims4P60191 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rims4P60191 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rims4P60191 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims4P60191 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims4P60191 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims4P60191 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims4P60191 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims4P60191 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims4P60191 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims4P60191 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims4P60191 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims4P60191 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rims4P60191 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rims4P60191 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rims4P60191 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rims4P60191 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rims4P60191 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rims4P60191 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rims4P60191 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rims4P60191 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rims4P60191 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rims4P60191 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rims4P60191 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rims4P60191 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims4P60191 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms