Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf16P58334 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms