Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpdl3bP58242 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms