Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2bP55271 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkn2bP55271 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms