Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pms2P54279 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pms2P54279 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pms2P54279 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pms2P54279 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pms2P54279 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pms2P54279 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pms2P54279 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pms2P54279 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pms2P54279 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pms2P54279 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pms2P54279 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pms2P54279 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pms2P54279 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms