Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms