Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpreP49446 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpreP49446 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpreP49446 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
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