Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk1P41969 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk1P41969 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Elk1P41969 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms