Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Mmp9P41245 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mmp9P41245 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mmp9P41245 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mmp9P41245 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mmp9P41245 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mmp9P41245 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mmp9P41245 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Mmp9P41245 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms