Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin1P35438 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin1P35438 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin1P35438 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin1P35438 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin1P35438 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin1P35438 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin1P35438 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin1P35438 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin1P35438 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin1P35438 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms