Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TpoP35419 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TpoP35419 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TpoP35419 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TpoP35419 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TpoP35419 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TpoP35419 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TpoP35419 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TpoP35419 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TpoP35419 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TpoP35419 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TpoP35419 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TpoP35419 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TpoP35419 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TpoP35419 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TpoP35419 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TpoP35419 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TpoP35419 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TpoP35419 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TpoP35419 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TpoP35419 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TpoP35419 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TpoP35419 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TpoP35419 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TpoP35419 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TpoP35419 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TpoP35419 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TpoP35419 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TpoP35419 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TpoP35419 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TpoP35419 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TpoP35419 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TpoP35419 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TpoP35419 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TpoP35419 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TpoP35419 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TpoP35419 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TpoP35419 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TpoP35419 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TpoP35419 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TpoP35419 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TpoP35419 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TpoP35419 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TpoP35419 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TpoP35419 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TpoP35419 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TpoP35419 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TpoP35419 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TpoP35419 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TpoP35419 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TpoP35419 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TpoP35419 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TpoP35419 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TpoP35419 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TpoP35419 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TpoP35419 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TpoP35419 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TpoP35419 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TpoP35419 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TpoP35419 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TpoP35419 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TpoP35419 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TpoP35419 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TpoP35419 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TpoP35419 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TpoP35419 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TpoP35419 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TpoP35419 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TpoP35419 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TpoP35419 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TpoP35419 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TpoP35419 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TpoP35419 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TpoP35419 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TpoP35419 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TpoP35419 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TpoP35419 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TpoP35419 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TpoP35419 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TpoP35419 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TpoP35419 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TpoP35419 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TpoP35419 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TpoP35419 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TpoP35419 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TpoP35419 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TpoP35419 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TpoP35419 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TpoP35419 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TpoP35419 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TpoP35419 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TpoP35419 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TpoP35419 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TpoP35419 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TpoP35419 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TpoP35419 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TpoP35419 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TpoP35419 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TpoP35419 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TpoP35419 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms