Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab17P35292 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab17P35292 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms