Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptk2P34152 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms