Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms