Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms