Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms