Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp1P29452 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp1P29452 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp1P29452 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp1P29452 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp1P29452 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp1P29452 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp1P29452 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casp1P29452 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Casp1P29452 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Casp1P29452 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp1P29452 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp1P29452 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Casp1P29452 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Casp1P29452 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp1P29452 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp1P29452 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp1P29452 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp1P29452 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp1P29452 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Casp1P29452 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Casp1P29452 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Casp1P29452 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp1P29452 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Casp1P29452 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp1P29452 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Casp1P29452 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Casp1P29452 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Casp1P29452 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Casp1P29452 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casp1P29452 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casp1P29452 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casp1P29452 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casp1P29452 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casp1P29452 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Casp1P29452 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casp1P29452 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casp1P29452 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Casp1P29452 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casp1P29452 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casp1P29452 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casp1P29452 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms