Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BgnP28653 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BgnP28653 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BgnP28653 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BgnP28653 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BgnP28653 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BgnP28653 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BgnP28653 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BgnP28653 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BgnP28653 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BgnP28653 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BgnP28653 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BgnP28653 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BgnP28653 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BgnP28653 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BgnP28653 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BgnP28653 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BgnP28653 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BgnP28653 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms