Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja4P28235 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja4P28235 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja4P28235 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja4P28235 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja4P28235 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Gja4P28235 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja4P28235 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja4P28235 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms