Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb3P28231 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms