Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms