Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjc1P28229 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.7 ms