Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Xrcc5P27641 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms