Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpbP27048 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms