Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms