Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpcP21841 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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SftpcP21841 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SftpcP21841 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpcP21841 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SftpcP21841 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpcP21841 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpcP21841 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SftpcP21841 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpcP21841 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpcP21841 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SftpcP21841 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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