Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Csn1s1P19228 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Csn1s1P19228 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Csn1s1P19228 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Csn1s1P19228 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Csn1s1P19228 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn1s1P19228 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms