Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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