Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms