Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18526 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18526 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18526 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18526 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18526 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18526 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P18526 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P18526 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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P18526 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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P18526 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18526 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18526 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18526 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18526 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18526 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18526 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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P18526 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
P18526 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P18526 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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P18526 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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P18526 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P18526 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
P18526 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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P18526 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18526 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18526 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18526 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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P18526 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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P18526 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P18526 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P18526 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P18526 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P18526 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P18526 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P18526 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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P18526 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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P18526 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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P18526 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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P18526 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18526 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18526 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18526 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18526 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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P18526 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18526 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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P18526 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18526 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18526 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
P18526 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18526 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18526 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P18526 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18526 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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