Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms