Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms