Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf1P15314 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irf1P15314 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf1P15314 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf1P15314 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irf1P15314 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms