Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms