Protein–RNA interactions for Protein: P13011

Scd2, Acyl-CoA desaturase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd2P13011 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd2P13011 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scd2P13011 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms