Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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