Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fv4P11370 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fv4P11370 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms