Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lire1P11260 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lire1P11260 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lire1P11260 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lire1P11260 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lire1P11260 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lire1P11260 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lire1P11260 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lire1P11260 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lire1P11260 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lire1P11260 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lire1P11260 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lire1P11260 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lire1P11260 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lire1P11260 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lire1P11260 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lire1P11260 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lire1P11260 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lire1P11260 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms