Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P10404 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P10404 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P10404 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P10404 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P10404 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P10404 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P10404 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P10404 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P10404 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P10404 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P10404 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P10404 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P10404 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms