Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp28P10078 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp28P10078 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp28P10078 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp28P10078 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp28P10078 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp28P10078 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp28P10078 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp28P10078 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp28P10078 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp28P10078 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp28P10078 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp28P10078 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp28P10078 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp28P10078 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp28P10078 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp28P10078 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms