Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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