Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms