Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna9P09235 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms