Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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