Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc8P09025 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc8P09025 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms