Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ifna6P07350 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifna6P07350 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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